人Y染色體探針法qPCR試劑盒
規(guī)格及成分
產(chǎn)品及特點(diǎn)
人Y染色體上95%是男性特異區(qū)域,里面含和男性有關(guān)的基因。本產(chǎn)品就是以其中一個基因?yàn)榘蟹肿?,設(shè)計的探針法熒光定量PCR產(chǎn)品,專門用于檢測樣品中是否有人Y染色體存在,它具有下列特點(diǎn):
1. 即開即用,用戶只需要提供樣品DNA模板。
2. 引物和探針經(jīng)過優(yōu)化,分析靈敏性高,可以達(dá)到10拷貝/反應(yīng)。
3. 提供陽性對照,便于排除假陰性實(shí)驗(yàn)。
4. 能檢測內(nèi)源性內(nèi)參基因(位于X染色體),便于排除假陰性樣品。
5. 特異性高,引物是根據(jù)人Y染色體高度保守區(qū)設(shè)計,不會跟人的其他染色體的DNA發(fā)生交叉反應(yīng)。
6. 既可用于定性檢測,又可用于定量檢測。用于定量時其線性范圍不少于5個數(shù)量級。
7. 本產(chǎn)品足夠50次20μL體系的探針法熒光定量PCR反應(yīng)。
8. 本產(chǎn)品只能用于科研。
規(guī)格及成分
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成分 |
規(guī)格 |
包裝 |
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2×Probe qPCR MasterMix |
0.5mL |
0.5mL本色管 |
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熒光PCR專用模板稀釋液 |
1mL |
1.5mL綠蓋管 |
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人Y染色體專一性引物-探針混合液(含內(nèi)參) |
150μL |
0.5mL棕色管 |
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人男性基因組DNA陽性對照(1×10E4拷貝/μL) |
50μL |
0.5mL黃蓋管 |
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KI多瘤病毒qPCR陽性對照(1E7拷貝/μL) |
50μL |
0.5mL白蓋管 |
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使用手冊 |
1份 |
無 |
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本產(chǎn)品采用5孔盒包裝 |
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使用方法
稀釋標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品以10E0-10E4拷貝/μL這5個10倍稀釋度為例
稀釋標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品以10E0-10E4拷貝/μL這5個10倍稀釋度為例
1. 標(biāo)記4個離心管,分別為3,2,1,0。
2. 分別加入45μL 熒光PCR專用模板稀釋液,用帶芯槍頭(下同)。
3. 在3號管中加入5μL 1×10E4拷貝/μL 的陽性對照(試劑盒提供),充分震蕩1分鐘,得1×10E3拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
4. 換槍頭,在2號管中加入5μL 1×10E3拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1×10E2拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
5. 換槍頭,在1號管中加入5μL 1×10E2拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1×10E1拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
6. 換槍頭,在0號管中加入5μL 1×10E1拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1×10E0拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
7. 上面的操作得到0-3號標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品,將試劑盒提供的人男性基因組DNA陽性對照(1×10E4拷貝/μL)當(dāng)成4號樣品,共5個樣品,放冰上待用。
樣品DNA的制備
8. 如果有N個樣品,設(shè)置N+2個提取,多出的一個是PC(樣品制備陽性對照,選用確定含Y染色體的樣本),一個是NC(樣品制備陰性對照,選用確定不含Y染色體的樣本)。
9. 用自選方法純化樣品DNA,本產(chǎn)品跟市場上大多數(shù)DNA提取試劑盒兼容。
Probe qPCR反應(yīng)20μL體系,在樣品制備室進(jìn)行
10. 如果做定量分析并且只做1次重復(fù),則標(biāo)記N+8個PCR管,其中N+2個用于上步得到的N+2個樣品,1個用于PCR陰性對照(本試劑盒提供的人女性DNA溶液),5個用于標(biāo)準(zhǔn)曲線。如果做定性分析并且只做1次重復(fù),則標(biāo)記N+4個PCR管,其中N+2個用于上步得到的N+2個樣品,1個用于PCR陰性對照(本試劑盒提供的人女性DNA溶液),1個用于PCR陽性對照(本試劑盒提供的人男性DNA陽性對照)。下面只以定量分析為例。
數(shù)據(jù)處理
1. 陰性陽性判斷:沒有Ct讀數(shù),或Ct大于45的PCR反應(yīng)結(jié)果判為陰性。有Ct讀數(shù),Ct值小于45,熒光信號有對數(shù)增長,有典型倒S型擴(kuò)增曲線的PCR反應(yīng)結(jié)果判為陽性。每個PCR反應(yīng)管需要同時對FAM通道和Cy5通道的結(jié)果分別進(jìn)行判定,得到對應(yīng)靶分子和內(nèi)參的兩個結(jié)果。
2. PCR實(shí)驗(yàn)有效性判斷:如果樣本制備陽性對照管或擴(kuò)增陽性對照管FAM通道結(jié)果為陰性,則整個實(shí)驗(yàn)無效,不需要分析數(shù)據(jù),需要分析原因,可能是操作、儀器和試劑三方面的原因,重做擴(kuò)增或制備或跟儀器和試劑廠家聯(lián)系。如果樣本制備陰性對照管或擴(kuò)增陰性對照管FAM通道結(jié)果為陽性,說明環(huán)境污染,則整個實(shí)驗(yàn)無效,不需要分析數(shù)據(jù),需要分析失敗原因,直到污染消除。如果上述陽性對照管和陰性對照管結(jié)果正常,則進(jìn)入下一步。
3. 樣本有效性判斷:如果樣本管FAM通道的結(jié)果為陽性,Cy5通道結(jié)果是陰性,則樣本的陽性結(jié)果有效。如果樣本管FAM通道和Cy5通道的結(jié)果均為陽性,并且FAM通道的Ct值小于Cy5通道的Ct值,則樣本的陽性結(jié)果有效。如果FAM通道的Ct值大于Cy5通道的Ct值,則樣本的陽性結(jié)果無效。如果樣本管FAM通道和Cy5通道的結(jié)果均為陰性,則此樣品管的陰性結(jié)果無效??赡茉蚴菢颖緛G失或有抑制劑,需要用其所對應(yīng)的樣品重新提取核酸和進(jìn)行PCR擴(kuò)增。
4. 如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的log值為橫軸,分別以陽性對照FAM通道和內(nèi)參Cy5通道的Ct值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,陽性對照FAM通道讀數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)曲線為斜線,r2必須大于0.95。內(nèi)參Cy5通道讀數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)曲線將跟FAM的標(biāo)準(zhǔn)曲線平行。再以待測樣品的Ct值從陽性對照FAM通道讀數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品DNA濃度的log值,再換算成濃度X拷貝/反應(yīng)。
5. 如果用于定性實(shí)驗(yàn),對待測樣品,如果其FAM通道的Ct沒有讀數(shù)、或Ct大于或等于45則均為陰性,如果小于45則為陽性。對任何FAM通道結(jié)果為陰性的待測樣本,如果其對應(yīng)的內(nèi)參Cy5通道也為陰性,則此樣品的陰性結(jié)果無效,此樣品需要重復(fù)實(shí)驗(yàn)。
自備試劑
樣品DNA
樣品DNA
運(yùn)輸及保存
低溫運(yùn)輸,-20℃保存,有效期1年
低溫運(yùn)輸,-20℃保存,有效期1年
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